Bitkilerde Yeni Nesil Dizileme Teknolojisi ile miRNA Analizi

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorEren, Abdil Hakan
dc.contributor.authorİlhan, Emre
dc.contributor.authorİnal, Behcet
dc.date.accessioned2024-12-24T19:18:42Z
dc.date.available2024-12-24T19:18:42Z
dc.date.issued2016
dc.departmentSiirt Üniversitesi
dc.description.abstractMiRNA'lar (mikroRNA), genlerin intron bölgelerinde bulundukları için proteine dönüşemezler ve kendi gen bölgelerinden üretilirler. Bitkilerde 21-24 nükleotitden oluşan miRNA üretimi çekirdekte başlar ve sitoplazmada koordineli bir şekilde devam eder. Bitkilerde gelişim ve stres ile ilişkili genlerin ifade seviyelerinin belirlenmesinden dolayı genom bütünlüğünün korunmasına yardımcı olur ve böylelikle ökaryotik genomların %30'unu kontrol ettiği savunulur. Bitkilerde küçük RNA'lar: miRNA; siRNA'lar, phasiRNA'lar ve NAT-siRNA gibi birçok ana sınıfa ayrılır. Bunları belirlemek ve fonksiyonlarını ortaya çıkarmak için çeşitli analiz yöntemleri geliştirilmiştir. Bu yöntemler Northern Blot, Flow Sitometri, Klonlama, qRT-PCR, Sekanslama ve Mikroarray analizleri ve RNA-seq (transkriptom profillemesi) şeklinde gruplandırılabilir. miRNA-Seq olarak adlandırılan ve Yeni Nesil Dizileme (YND) yöntemlerinden olan bu metotla türe ve dokuya spesifik miRNA'lar kolayca saptanabilmektedir. miRNA çalışmalarında; miRDeep-Seq, miRanalyzer, miRCat, miRExpress, miRTRAP gibi belirli algoritmalar kullanılabilmektedir. Bu derlemede bitkilerde yeni nesil dizileme teknolojilerinin miRNA dizileme (miRNA-seq) çalışmalarındaki uygulama alanı ile ilgili güncel çalışmalar irdelenmiştir.
dc.identifier.endpage454
dc.identifier.issn1308-7576
dc.identifier.issn1308-7584
dc.identifier.issue3
dc.identifier.startpage448
dc.identifier.trdizinid214884
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/214884
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12604/5296
dc.identifier.volume26
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.language.isotr
dc.relation.ispartofYüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.snmzKA_20241222
dc.subjectBiyoloji,Tıbbi Araştırmalar Deneysel,Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji,Viroloji,Genetik ve Kalıtım,Biyokimya ve Moleküler Biyoloji
dc.titleBitkilerde Yeni Nesil Dizileme Teknolojisi ile miRNA Analizi
dc.typeReview Article

Dosyalar

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu