Yazar "Yoltay, Murat" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 1 / 1
  • [ X ]
    Öğe
    Fıstıkta (Pistacia vera L.) mTERF gen ailesinin in siliko karakterizasyonun yapılması ve tuz stresi ile ilişkisinin araştırılması
    (Siirt Üniversitesi, 2023) Yoltay, Murat; İnal, Behcet
    Fıstıkta (Pistacia vera L.) Mitokondriyal transkripsiyon sonlandırma faktörleri (mTERF'lerin) gen ailesinin in siliko karakterizasyonun yapılması ve tuz stresi ile ilişkisinin araştırılması için bu çalışma gerçekleştirilmiştir. mTERF, mitokondriyal genlerin ifadesini düzenler, mitokondri ve kloroplastın işleviyle yakından ilişkilidir. Bu çalışmada, Plant Ensembl veri tabanı kullanılarak, fıstıkta 43 mTERF geni tespit edilmiştir. iTOL veri tabanı kullanılarak fıstık, mTERF filogenetik analize dayalı olarak sekiz ana gruba ayrılmıştır. Pv-mTERF PlantCARE veri tabanı kullanılarak promotörlerinin analizi, hücresel solunum ve fotosentezin düzenlenmesi ile ilgili birçok cis elementinin varlığını ortaya çıkarmıştır. WoLFPSORT veri tabanı kullanılarak hücre altı lokalizasyonları, MCScanX veri tabanı kullanılarak gen duplikasyon olayları, STRING veri tabanı kullanılarak protein dizilerinin işlevsel ontolojileri ve STRING veritabanı kullanılarak Protein-protein etkileşimlerinin fiziksel ve fonksiyonel etkileşimleri belirlenmiştir. Gen ontolojisi (GO), Pv-mTERF'leri öncelikle mitokondri ve kloroplast işlevi ve bileşimi ile ilişkilendirmiştir. Tandem ve segmental çoğaltma, fıstık genomundaki mTERF gen ailesinin genişlemesine katkıda bulunmuştur. Doku kültürü çalışmalarında 0 mM, 50 mM, 100 mM ve 150 mM konsantrasyonlarında tuz stresi uygulanmış ve gen ifade analizleri gerçekleştirilmiştir. Tuz stresine maruz bırakılan fıstık kalluslarında mTERF genlerinin ifade seviyesi diferansiyel yukarı veya aşağı regülasyona sebep olduğu tespit edilmiştir. Bu sonuçlar, mTERF genlerinin fıstıkta büyüme, gelişme ve stres tepkisindeki rollerini aydınlatmak için faydalı olacaktır. Anahtar Kelimeler: Doku kültürü, fıstık, gen ifadesi, mTERF, tuz stresi